ศูนย์เครื่องมือฯ มีภารกิจหลักคือการให้บริการห้องปฏิบัติการ เพื่อสนับสนุนการเรียนการสอนรายวิชาปฏิบัติการของมหาวิทยาลัย โดย มีกลุ่มห้องปฏิบัติการหลัก ดังนี้